Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab11fip1Q9D620 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms