Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ccdc39Q9D5Y1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ccdc39Q9D5Y1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ccdc39Q9D5Y1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ccdc39Q9D5Y1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc39Q9D5Y1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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