Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lpcat2bQ9D5U0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms