Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms