Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms