Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox2aQ9D4Y3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms