Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ribc2Q9D4Q1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms