Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms