Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubgcp4Q9D4F8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms