Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms