Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sohlh2Q9D489 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sohlh2Q9D489 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms