Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2lQ9D478 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2lQ9D478 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms