Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms