Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D3J9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D3J9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D3J9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D3J9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms