Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms