Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D2Q3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D2Q3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D2Q3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms