Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef12Q9D2F1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms