Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms