Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms