Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mdm1Q9D067 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms