Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610524H06RikQ9CZU9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms