Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms