Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shisa9Q9CZN4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Shisa9Q9CZN4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shisa9Q9CZN4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shisa9Q9CZN4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shisa9Q9CZN4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Shisa9Q9CZN4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms