Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms