Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sgo1Q9CXH7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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