Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms