Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smyd3Q9CWR2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms