Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms