Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms