Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrxn1Q9CS84 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Nrxn1Q9CS84 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrxn1Q9CS84 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrxn1Q9CS84 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms