Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRW3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms