Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc96Q9CR92 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc96Q9CR92 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc96Q9CR92 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc96Q9CR92 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc96Q9CR92 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc96Q9CR92 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc96Q9CR92 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc96Q9CR92 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms