Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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NmbQ9CR53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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NmbQ9CR53 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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NmbQ9CR53 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NmbQ9CR53 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NmbQ9CR53 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NmbQ9CR53 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NmbQ9CR53 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NmbQ9CR53 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NmbQ9CR53 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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