Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms