Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmd9Q9CR00 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmd9Q9CR00 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms