Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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