Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsenenQ9CQR7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms