Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms