Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms