Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms