Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms