Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms