Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scd3Q99PL7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms