Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rrbp1Q99PL5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrbp1Q99PL5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms