Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep41Q99NF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms