Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NsmfQ99NF2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms