Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms