Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms