Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Epdr1Q99M71 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epdr1Q99M71 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Epdr1Q99M71 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Epdr1Q99M71 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Epdr1Q99M71 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms