Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms